Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc88aQ5SNZ0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms