Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scarf1Q5ND28 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scarf1Q5ND28 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms