Protein–RNA interactions for Protein: Q5JCT0

Gcnt3, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt3Q5JCT0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcnt3Q5JCT0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms