Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C4

Vps13a, Vacuolar protein sorting-associated protein 13A, mousemouse

Predictions only

Length 3,166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13aQ5H8C4 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps13aQ5H8C4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps13aQ5H8C4 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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