Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnni3kQ5GIG6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms