Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2f8Q58FA4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2f8Q58FA4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms