Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Spire1Q52KF3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Spire1Q52KF3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms