Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Lrrc47Q505F5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrc47Q505F5 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms