Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Khdc1cQ4KL78 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms