Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ulk4Q3V129 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ulk4Q3V129 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms