Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ccdc185Q3V118 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ccdc185Q3V118 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ccdc185Q3V118 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ccdc185Q3V118 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ccdc185Q3V118 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ccdc185Q3V118 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ccdc185Q3V118 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ccdc185Q3V118 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ccdc185Q3V118 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ccdc185Q3V118 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ccdc185Q3V118 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ccdc185Q3V118 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ccdc185Q3V118 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc185Q3V118 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ccdc185Q3V118 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms