Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc43Q3V0L5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc43Q3V0L5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms