Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ttc9Q3V038 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ttc9Q3V038 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ttc9Q3V038 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ttc9Q3V038 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ttc9Q3V038 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ttc9Q3V038 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc9Q3V038 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc9Q3V038 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ttc9Q3V038 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ttc9Q3V038 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms