Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C87499Q3UX49 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C87499Q3UX49 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C87499Q3UX49 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C87499Q3UX49 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C87499Q3UX49 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C87499Q3UX49 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C87499Q3UX49 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C87499Q3UX49 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C87499Q3UX49 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C87499Q3UX49 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C87499Q3UX49 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C87499Q3UX49 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C87499Q3UX49 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C87499Q3UX49 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C87499Q3UX49 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C87499Q3UX49 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C87499Q3UX49 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms