Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
E330034G19RikQ3UWX6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms