Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Skap1Q3UUV5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Skap1Q3UUV5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms