Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm28047Q3US59 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm28047Q3US59 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms