Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm5460Q3UQ97 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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