Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPW2

Elf3, ETS-related transcription factor Elf-3, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf3Q3UPW2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Elf3Q3UPW2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms