Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Hdgfl2Q3UMU9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hdgfl2Q3UMU9 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hdgfl2Q3UMU9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hdgfl2Q3UMU9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Hdgfl2Q3UMU9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hdgfl2Q3UMU9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Hdgfl2Q3UMU9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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