Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cog7Q3UM29 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cog7Q3UM29 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms