Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKK2

Ceacam5, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam5Q3UKK2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ceacam5Q3UKK2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ceacam5Q3UKK2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms