Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm648Q3UJ22 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm648Q3UJ22 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Gm648Q3UJ22 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm648Q3UJ22 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm648Q3UJ22 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm648Q3UJ22 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm648Q3UJ22 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm648Q3UJ22 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm648Q3UJ22 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm648Q3UJ22 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Gm648Q3UJ22 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Gm648Q3UJ22 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Gm648Q3UJ22 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm648Q3UJ22 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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