Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc34Q3UI66 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc34Q3UI66 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms