Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrrc58Q3UGP9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Lrrc58Q3UGP9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Lrrc58Q3UGP9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Lrrc58Q3UGP9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lrrc58Q3UGP9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lrrc58Q3UGP9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrrc58Q3UGP9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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