Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nom1Q3UFM5 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nom1Q3UFM5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms