Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pid1Q3UBG2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pid1Q3UBG2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms