Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U595 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U595 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Q3U595 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Q3U595 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U595 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U595 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U595 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U595 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U595 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U595 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U595 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U595 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Q3U595 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U595 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U595 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U595 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U595 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U595 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Q3U595 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U595 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Q3U595 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U595 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U595 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U595 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U595 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U595 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Q3U595 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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Q3U595 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Q3U595 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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