Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam117bQ3U3E2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam117bQ3U3E2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam117bQ3U3E2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam117bQ3U3E2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Fam117bQ3U3E2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam117bQ3U3E2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam117bQ3U3E2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Gm15809-201ENSMUST00000159361 661 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Krtap13-201ENSMUST00000053149 882 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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Fam117bQ3U3E2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Fam117bQ3U3E2 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
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Fam117bQ3U3E2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Fam117bQ3U3E2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Fam117bQ3U3E2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Fam117bQ3U3E2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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Fam117bQ3U3E2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Fam117bQ3U3E2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam117bQ3U3E2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms