Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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Otud5Q3U2S4 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
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Otud5Q3U2S4 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Otud5Q3U2S4 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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