Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J0

Slc38a5, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a5Q3U1J0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc38a5Q3U1J0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms