Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem35bQ3U0Y2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms