Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Hhla1Q3TYV2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Hhla1Q3TYV2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hhla1Q3TYV2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Hhla1Q3TYV2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Hhla1Q3TYV2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Hhla1Q3TYV2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Hhla1Q3TYV2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hhla1Q3TYV2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms