Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Srsf6Q3TWW8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Srsf6Q3TWW8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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