Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Ccndbp1Q3TVC7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Ccndbp1Q3TVC7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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