Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trappc10Q3TLI0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trappc10Q3TLI0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms