Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pdlim7Q3TJD7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdlim7Q3TJD7 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms