Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Trappc13Q3TIR1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trappc13Q3TIR1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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