Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hddc2Q3SXD3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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