Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Colec11Q3SXB8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec11Q3SXB8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec11Q3SXB8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec11Q3SXB8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Colec11Q3SXB8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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