Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdss1Q33DR2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdss1Q33DR2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pdss1Q33DR2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pdss1Q33DR2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms