Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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H2-M3Q31093 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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H2-M3Q31093 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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H2-M3Q31093 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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H2-M3Q31093 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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H2-M3Q31093 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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H2-M3Q31093 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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H2-M3Q31093 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H2-M3Q31093 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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H2-M3Q31093 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H2-M3Q31093 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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