Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Myo3bQ1EG27 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms