Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpusd2Q149F1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpusd2Q149F1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms