Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpne7Q0VE82 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms