Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Neurl1bQ0MW30 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Neurl1bQ0MW30 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms