Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TrioQ0KL02 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms