Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc7a1Q09143 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms