Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms