Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

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Length 526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
MitfQ08874 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms